舞台となるのは1890年のアメリカ。元騎手であり、今は下半身不随となっているジョニィ・ジョースターは、北米大陸横断レース「スティール・ボール・ラン」のスタート地点を訪れていたが、参加者のひとりであるジャイロ・ツェペリの持つ鉄球の回転に触れたことにより、一瞬ではあるが立ち上がることに成功。その力の謎を知るため、ジョニィ・ジョースターもレースへの参加を決意する。 やがて協力関係を築くふたりではあるが、レースに隠された「聖なる遺体」の争奪戦に巻き込まれ、レースで勝利を目指す者、聖なる遺体を狙う者たちが入り乱れた激闘を続けることとなる。そしてすべての陰謀の黒幕は、アメリカ合衆国大統領であるファニー・ヴァレンタインであった。 アメリカ合衆国が世界の中心となるためには聖なる遺体が必要だと考えるファニー・ヴァレンタインは、あらゆる犠牲を払って遺体の部位の独占を狙う。一方、夫のスティーブン・スティールが大統領に利用され、このままでは命が危ないことを知ったルーシー・スティールだったが、彼女自身も聖なる遺体を巡る陰謀に巻き込まれることとなり、いつしか事件の中心へと導かれていく。