東京都立クロマティ高校(クロ高)は、引き算ができれば入学できる学校として知られ、不良の巣窟になっていた。真面目で成績も優秀な少年神山高志は、とある理由でここに入学してしまう。不良たちの迫害に耐えているうち、いつしか林田慎二郎や前田彰などと仲間になり、クラスに溶け込んでいく。しかし、クロ高には、想像もつかないような者達まで潜んでいた。さらに、クロ高と対立する他高校の番長も現れ、状況はますます混乱に向かっていく。