「バイオ・バグ」という、手に穴が開き、吸い込んだものと人間が融合してしまう病気が蔓延、発症者は「穴あき(バグラー)」と呼ばれる世界。高校生の藤井はクラスメイトである「穴あき(バグラー)」の少女、榎本芙三歩に恋心を抱きながら、親友の穂坂正路(ホサ)や井本極子(キワ)らと学園生活を過ごしていた。ある日藤井もバイオ・バグが発症。芙三歩と同じ身体となったことでいっそう思いを強めていく。一方、巷では「穴あき(バグラー)」を狙った連続殺人事件が多発していた。藤井の誕生会の日、誘ったはずのホサが顔を出さないのを心配した藤井とキワは、ホサを探しに行く。そこで二人が見たのは、「穴あき(バグラー)」を狙う殺人犯とホサが戦っている場面であった。犯人によって瀕死の重傷を負ったホサを助けるため、藤井はホサと融合することを決意する。