忍者の甲賀卍谷衆と伊賀鍔隠れ衆は数百年に渡り対立していたが、約定により不戦が保たれていた。互いの跡取りである弦之介と朧が恋仲となり、確執も解けるかと思われたその折、両家の頭領は徳川家康に呼び出された。甲賀と伊賀は、徳川幕府の跡目争いを収めるべく、代表十名ずつによる代理戦争を命じられる。一族の浮沈を賭けた忍者の死闘に、弦之介と朧の運命は変化していく。